Центр підвищення кваліфікації персоналу є одним з основних організаційних і навчальних структурних підрозділів академії. Центр був створений у травні 2000 року, для проведення підвищення кваліфікації керівного складу підрозділів та перепідготовки офіцерського складу та інших категорій персоналу Державної прикордонної служби України з питань охорони державного кордону.
Центр підвищення кваліфікації персоналу з вересня 2016 року очолює полковник Цимар Роман Володимирович.
Заступник начальника центру підвищення кваліфікації персоналу підполковник Гнатишен Олег Борисович.

Курси підвищення кваліфікації керівного складу та персоналу органів, підрозділів охорони державного кордону - начальник курсу підполковник Гуцалюк Сергій Васильович. Головне завдання курсу – здійснення підвищення кваліфікації керівного складу та персоналу органів, підрозділів охорони державного кордону за напрямами діяльності та додаткового професійного спрямування.
Курси підвищення кваліфікації персоналу підрозділів забезпечення охорони державного кордону - начальник курсу підполковник Манчул Олег Петрович.
Головне завдання курсу – здійснення підвищення кваліфікації персоналу підрозділів забезпечення охорони державного кордону за напрямами діяльності в галузях охорони державного кордону та їх відповідного професійного спрямування.
Курси підготовки офіцерів і прапорщиків (мічманів) для охорони закордонних дипломатичних установ - начальник курсу підполковник Зацепін Олексій Євгенович. Головне завдання курсу – підготовка фахівців за напрямом підготовки “Охорона та захист Державного кордону”, офіцерів та прапорщиків для охорони закордонних та дипломатичних установ.
Курси підготовки офіцерського складу - начальник курсу підполковник Юрчак Юрій Миколайович. Головне завдання курсу – здійснення підготовки офіцерів за відповідними спеціальностями та додатковим професійним спрямуванням.
Курси мовної підготовки – начальник курсу майор Зарічна Вікторія Вікторівна. Головне завдання курсу – організація іншомовної підготовки за професійним спрямуванням персоналу Державної прикордонної служби України.
Курси дистанційного навчання – начальник курсу підполковник Хом`як Сергій Любомирович. Головне завдання курсу – здійснення підвищення кваліфікації персоналу Держприкордонслужби в системі професійної підготовки за дистанційною формою навчання.

2017  Національна академія Державної прикордонної служби України